ProAR: Probabilistic Autoregressive Modeling for Molecular Dynamics
本文提出了名为 ProAR 的自回归概率建模框架，通过双网络架构与抗漂移采样策略，有效解决了现有生成模型在分子动力学轨迹生成中无法处理任意长度序列及时间依赖性构象变化的问题，并在长轨迹重建精度与构象变化准确性上显著优于现有最先进方法。
📄 Category
molecular biology
204 篇论文
分子生物学探索着生命的核心密码，揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论，而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science，我们致力于打破学术壁垒，让这些前沿发现触手可及。
本栏目收录的所有预印本均源自 bioRxiv。我们团队会逐一处理该分类下发布的最新预印本，为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与详尽的技术摘要，无论您是专业研究者还是科学爱好者，都能轻松掌握核心发现。
以下是该领域最新发布的预印本论文列表，欢迎浏览探索。
ATM safeguards DNA replication at endogenous base lesions
该研究揭示了 ATM 激酶通过抑制 PRIMPOL 介导的异常重引发并调控复制叉停滞，从而防止自发氧化碱基损伤导致复制后修复缺陷，阐明了 ATM 缺失细胞对 PARP 抑制剂产生合成致死效应的分子机制。
Pathogenic Leptospira in dogs and rodents in Tha Wang Pha, Thailand - Prevalence, diversity and linked environments
该研究在泰国南府 Tha Wang Pha 地区首次证实了鼠类携带 L. weilii，并发现流浪狗可能作为桥梁宿主，将多种病原性钩端螺旋体从农田和森林中的啮齿动物传播至人类，强调了在该地区实施“同一健康”综合监测的重要性。
Evaluating codon optimization strategies for mammalian glycoprotein production with an open-source expression vector
该研究利用开源表达载体 pTipi 系统评估了多种密码子优化策略，发现对于哺乳动物同源糖蛋白表达而言，使用天然密码子序列已足以实现稳健生产，而仅在某些特定情况下，采用偏好高频密码子的偏斜策略才能进一步提升产量。
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
本研究利用单细胞 RNA 测序技术解析了蜱虫胚胎细胞系 ISE6 的细胞异质性及其对 Ehrlichia muris eauclairensis 感染的转录响应，揭示了感染早期应激适应与代谢通路的上调及晚期细胞周期和细胞骨架相关基因的下调，从而证实了该细胞系作为研究蜱传病原体互作及分离培养的有效资源。
Systematic identification of tissue-conserved m6A sites reveals a stable epitranscriptomic regulatory layer controlling essential genes
该研究系统鉴定了人类 24 种组织中保守的 m6A 修饰位点，揭示了由 RBM15/B 介导、YTHDF/UPF1 识别的稳定表观转录组调控层，该层通过标记维持细胞稳态的关键基因，其失调可能驱动癌症中的转录异常。
No phenotypes in Ttc22 knockout mice
本研究利用 CRISPR-Cas9 构建的 Ttc22 基因敲除小鼠模型，证实尽管 Ttc22 缺失会部分上调结肠黏膜炎症相关基因，但该基因失活并未对小鼠的生长发育、繁殖力、自发肿瘤发生率或 AOM/DSS 诱导的结肠癌发生产生任何表型影响。
Combination of alpha-synuclein aggregation inhibitor anle138b and ER stress inhibitor AMG PERK 44 increases neuroprotection in Parkinson's disease organoid model
该研究在帕金森病类器官模型中证明，联合使用α-突触核蛋白聚集抑制剂 anle138b 与内质网应激抑制剂 AMG PERK 44，能通过增强神经元代谢活性、减少α-突触核蛋白聚集与磷酸化、降低多巴胺能细胞死亡及恢复蛋白质稳态，从而显著放大神经保护效果。
FYCO1 improves postischemic cardiac remodeling via enhanced autophagic flux and attenuation of proinflammatory signaling
该研究揭示 FYCO1 作为心肌细胞中自噬的关键调节因子，通过增强自噬通量并抑制促炎信号，有效减轻心肌梗死后的组织重塑并改善心脏功能。
A GABARAP-PtdIns3K-C1 positive feedback loop at the heart of the phagophore nucleation
该研究揭示了一个由 GABARAP 激活 PtdIns3K-C1 复合物从而促进 PtdIns3P 生成的正反馈回路，该机制解决了细胞在饥饿条件下如何快速合成大量膜结构以形成自噬体的关键问题。